健全檢察制度、杜絕檢察官濫權起訴、防止司法資源浪費...，國人企盼「司法改革」。檢察官為公益代表，有所謂「捍衛公益型」。西方刑事訴訟普遍經歷了從「自訴」到「公訴」的轉變，檢察官逐漸成為國家利益的代言人。我國刑法第一百二十五條第一項第三款規定濫權追訴處罰罪，「明知」為無罪之人，而使其受追訴或處罰，或「明知」為有罪之人，而無故不使其受追訴或處罰者。另有「媒體作秀型」、「政客打手型」及「公器私用型」等，為非作歹，檢察官的究責機制，有強化之必要。

過往檢察官辦案只在乎「起訴 不起訴」，久而久之檢察官就成了辦案的機器，真正能深入調查案情者幾希？也因為如此檢察官更是擴張自己的權力。有些恐龍檢察官會因當事人不配合其引導的筆錄，而當面摔卷宗、辱罵、威脅家人等等，造成當事人得恐懼不安，甚至噩夢連連。篡改筆錄也是這類檢察官常用的伎倆，「馬案」因侯寬仁檢察官竄改筆錄，這是最經典的；違反證據法則，這是造成冤案的罪魁禍首，這種違背良心的作法，怎不怕天譴呢？強行逼供，草菅人命，真不知冤案如何善了？

真理大學法律系副教授暨法稅改革聯盟發起人吳景欽指出，不只是在太極門案如此，周人蔘案、前總統馬英九案等，侯寬仁辦案充滿瑕疵、違反法律規定「族繁不及備載」，這樣的檢察官不僅沒有被汰除，反而自恃有長官罩，可以一路升官到法務部法醫研究所所長，是對人權立國最大的諷刺。日前侯寬仁將「CT車〈X光〉勘驗車」，開到法務部門口高調宣傳，勘驗車應在第一線協助釐清確實死因，竟以宣傳為優先，做秀心態完全沒改變，與其過去帶著媒體記者辦案，當眾公佈案情內容，違反偵查不公開的做法一致，過去甚至還接受社論性質媒體節目暢談案情，更有所謂用眼神辦案的負面經典之舉，這樣是一個民主法治國家該有的法治態度嗎？

此外，侯寬仁上任後即推動將法醫研究所改制國家司法科學研究院，還把所有刑事鑑定全納入業務範圍，這也是侯一慣的擴權心態，與其在偵辦太極門案，完全沒有任何證據，竟然可以越權發文要求縣市政府對太極門道館斷水斷電完全一樣，幸好當時沒有相關官員敢執行，也會驚嘆侯寬仁檢察官權力如此之大！

檢察官與法醫研究所同屬法務部，鑑定易受檢察官偏見所影響，誤判、冤罪就可能產生，如若未來警察局或民間實驗室所做鑑定，不符檢察官期望，可以送研究院做複審跟複鑑，等同太上皇機關，自審自鑑，自己說了算，將是嚴重的問題。讓一個不以科學辦案、不公正、不客觀的檢察官擔任法醫研究所所長，甚至未來成為國家科學研究院院長，茲事體大。