中選會10月24日公告10公投案意見書後，11月2日再修改及重新公告意見書。下一代幸福聯盟發起的愛家公投(反對修《民法》納入同性婚姻)對此不滿，並向高等行政法院申請假處分，經法院裁定停止執行違法公投通告。對此，中選會主委陳英鈐回應，法院在裁定前並未徵詢中選會意見，且7日裁定、中選會9日才收到裁定，「將依法提起抗告」。

國民黨反核食公投與愛家公投，都遇到公投公報裡的意見書被修正的情形。下一代幸福聯盟13日召開記者會指出，中選會修改的主文內容為「本案若獲通過。。。 進行同性婚姻相關法規修正工作並送立法院議決」，但12號公投主文正確的應該是，「你是否同意以《民法》婚姻規定以外之其他形式來保護同性別兩人經營永久共同生活的權益？」

公投發起人曾獻瑩抨擊，中選會企圖透過更動文字來扭曲愛家公投提案原意，台北高等行政法院裁定應停止執行下，仍照常印發選舉公報，要求中選會立刻回收更正公報，並對此向全民道歉。

中選會主委陳英鈐回應記者的提問指出，中選會已在10月24日完成法定義務公告，行政院在10月29日來文進行文字修正，希望讓民眾更了解其立場，並沒有更改公投主文，依公投第6案的前例給予修正，符合公投法要兩面具陳主文理由書跟相關機關意見書的精神，至於行政院修改內容部分，因中選會是獨立機關，不便表示意見。

至於高等行政法院對於愛家公投的假處分裁定，中選會認為北高行違反行政訴訟法，在做停止執行裁定前，並未徵詢中選會意見，而且收到裁定書時，大部分選委會已印製完成公投公報，也發送到各區公所。他強調，中選會是獨立機關，對人民提案和政府意見都予以尊重。【記者 黎明曉整理報導】