蕈類為何會發光？一直是科學家好奇的問題。2018年，俄羅斯科學家已發現蕈類發光的主要基因簇，但基因體結構及演化歷史，仍待探索。蕈類最早的發光基因，始於1.6億年前，但因演化機制的特殊性，而逐漸被淘汰。

台灣中研院最新研究「以小菇屬基因體解析真菌發光之演光」的研究指出，若能掌握完整的基因體，研究其變異的歷史，將有機會完整的探討蕈類調控發光之機制、目的。研究成果11月發表於「美國國家科學院院刊（PNAS）」，是全球第一篇探索真菌發光基因演化之學術文章，且被選為當期的封面故事。

中研院生物多樣性研究中心蔡怡陞副研究員指出，一個生物體內的基因體，是由一個個基因排列組成基因簇（gene cluster），再組成完整的基因體。基因體的結構差異，是決定不同的物種。真菌生物特徵的展現，大多是由基因簇所調控。研究團隊針對台灣小菇支系，採集４種發光及１種不發光的物種，解序其基因體。依據基因演變往前追溯，透過化石資料分析42個菇類，共超過50萬個基因，推算出世界上第一株發光蕈類，應是出現於距今1.6億年前的侏羅紀。

蔡怡陞表示，發光蕈不是一直都在發光，不同組織、發育階段，會有不同的發光程度；有些菌絲發光，有些則在實體的柄或蕈蓋發光。研究團隊還發現，於不同發育階段及組織，有些基因的表現量，是跟著發光基因簇同時改變，顯見這些基因，可能正調控著發光程度。團隊也推測，小菇支系的發光基因簇，在演化過程中不斷重組，部分發光的功能因此漸漸被淘汰，導致目前存在的發光基因散落在不同分支。而現今發光蕈類的存在，可能是其冷光恰好對適應環境有所幫助。若能進一步掌握其調控，將更進一步助瞭解真菌調控發光的生態意義。

蔡怡陞更指出，這些發光蕈類的基因，可活用於各領域，持續探索這些蕈類的基因體，有助於提升生物資源的利用。該研究論文共同作者柯惠棉博士則表示，這是全球首度發表的小菇支系完整基因體的研究，對於了解生物在面對不同環境的生存策略，也供了研究的藍圖。本次研究的５個物種，皆採集於台灣，台灣發現的墾丁小菇及金星小菇，亦將成為國際研究真菌的重要資源。【記者  鄭昱庭整理報導】